基因测序是如何发现病毒基因与境外变异株高度相似的?
6日,记者从北京市疾控中心据悉,此前其通报:重庆市8月2日新增的1例新冠哮喘确诊病例感染的新冠病毒基因测序结果显示,属于德尔塔(delta)变异株,与境外德尔塔变异株同源性较高。基因同源性较高是哪些意思?基因测序是怎样发觉病毒基因与境外变异株高度相像的?来看北京市疾控中心的解答↓
新冠病毒如同一条项链,可以由不同的佛珠串上去,戒指上的每颗佛珠都是具有特殊功能的基因。当把圆珠放大,都会发觉每颗佛珠都是由四种核苷酸紧密排列组成的。所以,基因测序就是先发觉佛珠,再放大看其中的核苷酸是如何排列的;当把核苷酸排列情况认清楚时,就可以完全测定下来新冠病毒的核苷酸序列。
新冠病毒这条“手链”的宽度为29903(约3万)个核苷酸。在先前技术不是这么发达的时侯,技术人员测定整个基因组可能要花费数周甚至数月的时间。随着科学技术的发展,凭着全基因组测序技术,可以一次性完成之前数月的工作。其实,这项技术操作上去比较复杂,不仅仅须要在实验室里进行,还须要高性能计算机,起码剖析数小时就能完成。
还是拿戒指打比方,通过对比不同“手链”的差别,我们可以将相像的“链子”归到同一个“系列”,这个过程叫分型。
各类分型方式的原理是类似的,都是借助病毒传播过程中核苷酸序列上特定位置的变化来进行分型,这对防治工作非常重要,是明晰病毒来源并调整防治策略的重要根据之一。
为何能通过基因测序锁定病毒来源
广州市疾控中心对北京市8月2日病例的呼吸道标本举办了新冠病毒全基因组序列测定,结果显示,即使该病毒属于德尔塔型德尔塔毒株和新冠病毒一样吗,但它的变异情况和一株北美株高度相像,而与近日我国其他地区的病例感染的病毒变异不一样。结合病例的工作性质,因而推断这次本土病例感染来源很可能是国外而不是国外其他地区。
6日,记者从北京市疾控中心据悉,此前其通报:重庆市8月2日新增的1例新冠脑炎确诊病例感染的新冠病毒基因测序结果显示,属于德尔塔(delta)变异株,与境外德尔塔变异株同源性较高。基因同源性较高是哪些意思?基因测序是怎样发觉病毒基因与境外变异株高度相像的?来看北京市疾控中心的解答↓
新冠病毒如同一条项链,可以由不同的佛珠串上去,戒指上的每颗佛珠都是具有特殊功能的基因。当把圆珠放大,都会发觉每颗佛珠都是由四种核苷酸紧密排列组成的。所以,基因测序就是先发觉佛珠,再放大看其中的核苷酸是如何排列的;当把核苷酸排列情况认清楚时,就可以完全测定下来新冠病毒的核苷酸序列。
新冠病毒这条“手链”的宽度为29903(约3万)个核苷酸。在先前技术不是这么发达的时侯,技术人员测定整个基因组可能要花费数周甚至数月的时间。随着科学技术的发展,凭着全基因组测序技术,可以一次性完成之前数月的工作。其实,这项技术操作上去比较复杂,不仅仅须要在实验室里进行,还须要高性能计算机,起码剖析数小时就能完成。
还是拿戒指打比方,通过对比不同“手链”的差别,我们可以将相像的“链子”归到同一个“系列”,这个过程叫分型。
各类分型方式的原理是类似的,都是借助病毒传播过程中核苷酸序列上特定位置的变化来进行分型,这对防治工作非常重要,是明晰病毒来源并调整防治策略的重要根据之一。
为何能通过基因测序锁定病毒来源
广州市疾控中心对北京市8月2日病例的呼吸道标本举办了新冠病毒全基因组序列测定,结果显示,即使该病毒属于德尔塔型,但它的变异情况和一株北美株高度相像,而与近日我国其他地区的病例感染的病毒变异不一样。结合病例的工作性质,因而推断这次本土病例感染来源很可能是国外而不是国外其他地区。
病毒发生变异后,这种变异会遗传给病毒的下一代而且不大可能返祖德尔塔毒株和新冠病毒一样吗,也就是说处在同一传播链条上的病例带有的病毒肯定会包含之前传播者带有的病毒的全部变异。为此,通过比较病毒变异是否一致,我们就可以判定两个病例之间是不是在同一传播链上,一例一例比较后能精准地推论病毒的来源。
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